作为学校大型仪器公共服务平台的重要组成部分,我校的高性能计算集群系统经过三年多的筹备建设,已经具有了一定的规模。随着我校科研水平的不断提升,对高性能计算平台的需求越来越高,学校逐步加大了对高性能公共平台的投入。2009年建设初期系统只有64个计算节点,10T的存储硬盘空间。经过三期的连续投入,我校的高性能计算平台目前含有270个计算节点,40个GPU节点,200T的硬盘存储空间,系统配备200T的Lustre并行文件系统,通过Infiniband (IB)网络挂载Lustre并行文件系统。实际运行速度为55Tflops(峰值浮点运算能力,双精度),在2011年全国超算TOP100中排名第70位,较好地顺应了我校科研发展的需要。
目前我校利用该系统开展的研究项目众多,国家重大基础研究计划(973)项目、国家自然科学基金面上项目等就有30余个,项目经费超过2400万元人民币。应用的领域涉及计算物理、材料设计、信息科学、计算化学、光谱学以及波谱学、分子动力学、地球物理、大气环境研究、密码学和并行符号计算等重要学科,褚君浩院士团队、何积丰院士团队、张增辉教授团队等许多研究团队都利用该集群系统进行课题研究。
利用本系统开展课题研究的项目数与项目经费累计值
利用本系统开展课题研究的论文发表数累计值
高性能计算集群系统在我校的科研活动中发挥着重要的作用。利用本系统开展课题研究的发表论文数逐年上升,从2009年全年的14篇到2012年年中的34篇。2009年1月系统建成至2012年年中,共发表包括JACS、PRL等顶级刊物的SCI检索论文100余篇,其中影响因子最高达到12。
据统计,自2012年1月三期建设以来,该系统共运行作业35000多个,排队等待运行的作业基本上在30个左右。排队的时间基本上在3天以上,特别是200个核以上的作业排队时间更长,且在使用过程中,发现目前的计算资源只能满足小尺度的计算要求,如张增辉教授团队所提出的计算大尺度课题的要求则不能满足。
图为我校超算中心机房
鉴于我校高性能计算集群目前的使用状况,作为我校公共服务平台的高性能计算系统应跟踪需求,学校将进一步加大投入,以满足全校各学科的教学、科研的计算需求,为顺利完成各学科的科研任务提供强有力的支撑。